Après avoir ouvert la marque avant la pause sur une tête de Frenkie de Jong (39e), à la réception d'un centre d'Antoine Griezmann, le club catalan relance la formation basque. Les joueurs d'Imanol Alguacil profitent d'une main de Frenkie de Jong dans la surface pour égaliser sur penalty, transformé par Mikel Oyarzabal (51e). Les Blaugrana l'emportent aux tirs au but grâce une dernière tentative réussie par Riqui Puig.
En finale, le Barça sera opposé au Real Madrid ou à l'Athletic Bilbao, qui s'affrontent jeudi soir à Malaga.