Entre 2007 et 2010, Eduardo a porté le maillot d'Arsenal. Le manager Arsène Wenger regrette vraiment que l'attaquant brésilo-croate n'ait pas réussi à briller plus souvent à l'Emirates Stadium.
“J'étais heureux de l'avoir recruté. Il y avait deux grands joueurs, Modric et Eduardo, dans l'équipe de Zagreb à l'époque. Ils ont eu des grandes carrières. Le regret que nous avions pour Eduardo était bien entendu sa grave blessure (double fracture tibia-péroné). Mais il était un grand joueur. Nous avons de bons souvenirs de lui et il est toujours aimé dans notre club”, a souligné Arsène Wenger d'après le site officiel des Gunners.